南京能考研的高校包括以下几所：

南京大学

东南大学

南京航空航天大学

南京理工大学

河海大学

南京师范大学

南京农业大学

南京林业大学

南京邮电大学

南京信息工程大学

南京工业大学

南京审计学院

南京财经大学

南京医科大学

南京中医药大学

常州大学

建议考生根据自己的兴趣和专业方向，选择合适的大学进行报考。