三牌楼地区拥有以下学校：

小学 ：

南京市三牌楼小学：位于南京市鼓楼区新模范马路94号，是江苏省省级实验小学。

回龙桥小学：属于三牌楼小学教育集团。

察哈尔路小学：同样属于三牌楼小学教育集团。

鼓楼第二实验小学：包含鼓楼区第二实验小学、小市中心小学、建宁小学、天河实验小学。

天正小学：属于天正小学教育集团。

赤壁路小学：加入了新的教育集团。

初中 ：

50中（南京市第五十中学）：位于三牌楼南面一点的马台街，被称为小南师。

育英外国语学校：位于附近的福建路，是一所私立中学。

高等教育机构 ：

南京邮电大学（Nanjing University Of Posts And Telecommunications），简称“南邮”，在三牌楼设有校区。

这些学校涵盖了从小学到高等教育各个阶段的教育资源，为当地居民提供了丰富的教育选择。