复旦大学和中国科学技术大学都是中国顶尖的高等教育机构，各有其优势。 具体哪个更难考，需要根据考生的报考地点和目标专业来综合考虑 。

在安徽理科招生时 ：

复旦大学2023年最低分为678分，位次为275名。

中国科学技术大学2023年最低分为670分，位次为695名。

因此，在安徽理科招生时，复旦大学的分数线和位次都高于中国科学技术大学， 复旦大学相对更难考一些 。

在上海理科招生时 ：

中国科学技术大学2023年最低分为586分，位次为1670名。

复旦大学2023年最低分为546分，位次为8464名。

因此，在上海理科招生时，中国科学技术大学的分数线和位次都高于复旦大学， 中国科学技术大学相对更难考一些 。

从整体录取难度来看 ：

复旦大学作为一所位于上海的顶尖高校，其招生竞争非常激烈，尤其是在上海本地招生时，分数线相对较低，但位次较高，反映出其录取难度大。

中国科学技术大学虽然分数线相对较低，但其位于安徽省，且作为理工科强校，其录取难度也不容小觑，尤其是在理工科专业上。

综合来看 ：

如果考生目标是上海的理工科专业，中国科学技术大学可能更难考一些。

如果考生目标是上海的文科专业或其他省份的理工科专业，复旦大学可能更难考一些。

如果考生目标是安徽的理工科专业，中国科学技术大学可能相对更好考一些。

建议考生在选择学校和专业时，综合考虑自己的兴趣、职业规划以及各个学校的录取情况和专业优势，做出最适合自己的选择。