武警海警学院的专业设置主要围绕海警机构的海上维权执法使命任务，构建了以维权执法和船艇指挥为重点的学科专业体系。以下是学院开设的一些主要专业：

侦察情报专业 ：培养具备侦察技术、海警情报工作、情报安全、海上维权执法及作战指挥相关基础知识的初级指挥警官。

航海技术专业 ：培养掌握航海学、航海仪器、舰艇雷达以及航海气象等相关学科领域的专业基础理论知识和技能，胜任海警机构船艇指挥岗位任职需要的初级指挥警官。

法学专业 ：培养掌握刑法、刑事诉讼法、行政法与行政诉讼法以及国际法等相关学科领域的专业基础理论知识和技能，胜任海警机构维权与执法岗位任职需要的初级指挥警官。

作战指挥专业 ：分为维权执法和船艇指挥两个方向，培养掌握作战指挥学基础、军事运筹学、海警指挥信息系统等相关学科领域的专业基础知识和技能，胜任海警机构维权与执法或船艇指挥岗位任职需要的初级指挥警官。

电子信息工程专业 ：培养具备电子信息工程相关学科基础理论知识和技能，胜任海警机构相关岗位任职需要的初级指挥警官。

轮机工程专业 ：培养具备轮机工程相关学科基础理论知识和技能，胜任海警机构相关岗位任职需要的初级指挥警官。

治安学专业 ：培养具备治安学相关学科基础理论知识和技能，胜任海警机构相关岗位任职需要的初级指挥警官。

这些专业旨在培养具备专业理论知识和实践技能的海警人才，以适应海警机构在海上维权执法、船艇指挥、情报侦察、法律维权等多方面的需求。