上智大学的专业设置涵盖了广泛的学术领域，具体包括以下专业：

神学院 ：

神学科

文学院 ：

哲学专业

历史学专业

日本文学专业

英国文学专业

德国文学专业

法国文学专业

新闻学专业

保健体育研究室

法学院 ：

法律专业

国际关系法专业

地球环境法专业

经济学院 ：

经济学专业

经营学专业

外国语学院 ：

英语专业

德语专业

法语专业

西班牙语专业

俄语专业

葡萄牙语专业

综合国际学院（综合グﾛｰバﾙ学院） ：

综合国际学科

国际教养学院 ：

国际教养学科

综合人间科学学院 ：

教育学科

心理学科

社会学科

社会福祉学科

看护学科

理工学部 ：

物质生命理工学科

机能创造理工学科

情报理工学科

研究院 ：

神学研究科：神学专攻（博士前期课程）、组织神学专攻（博士后期课程）

哲学研究科：哲学专攻

文学研究科：史学专攻、国文学专攻、英美文学专攻、德国文学专攻、法国文学专攻、新闻学专攻、文化交涉学专攻

综合人类科学研究科：教育学专攻、心理学专攻、社会学专攻、社会福祉学专攻、看护学专攻（修士课程）

法学研究科：法律学专攻、法曹养成专攻（专门职学位课程）

这些专业为学生提供了丰富的学术选择，涵盖了从神学到文学、法律、经济、工程、情报学等多个领域。上智大学作为一所综合性研究型大学，其专业设置旨在培养具有国际视野和专业知识的人才。