钦州高考成绩相对落后的原因可以从以下几个方面进行分析：

教育资源分配不均 ：

师资力量 ：南宁作为广西壮族自治区的首府，拥有更多的教育资源和优质师资，而钦州相对较少。这导致钦州的教育质量整体较低，影响了学生的学习成绩。

教学设施 ：南宁的学校在教学设施方面相对完善，而钦州的一些学校可能缺乏先进的教学设备，影响了教学效果。

学生基础差异 ：

中考成绩 ：虽然钦州和南宁的中考成绩相差不大，但钦州的高中录取线较低，导致进入高中的学生整体水平不如南宁的学生。

学习习惯和兴趣 ：钦州的学生可能在学习习惯和兴趣方面不如南宁的学生，这也影响了他们的高考成绩。

高考竞争压力 ：

报考人数 ：钦州的高考报考人数相对较少，但报考名校的竞争压力并不因此减小。这使得钦州的学生在高考中面临更大的竞争压力。

考试策略 ：钦州的学生在高考备考策略上可能存在不足，导致考试成绩不理想。

高校招生政策 ：

招生名额 ：高校在广西的招生名额相对有限，且往往更倾向于录取南宁等教育资源丰富的地区的学生。这使得钦州的学生在高考录取时处于不利地位。

社会经济因素 ：

家庭背景 ：钦州地区的家庭经济条件相对较差，可能无法为学生提供更多的学习资源和辅导，影响了学生的学习效果。

经济支持 ：家庭的经济支持不足可能导致学生无法参加各种课外辅导和培训，从而影响高考成绩。

综上所述，钦州高考成绩落后的原因是多方面的，包括教育资源分配不均、学生基础差异、高考竞争压力、高校招生政策以及社会经济因素等。要改善钦州的高考成绩，需要从多个方面入手，综合施策，提高教育质量，缩小与先进地区的差距。