南京航空航天大学的王牌专业包括：

飞行器设计与工程 ：涵盖飞行器设计、制造、试验、运行和管理等方面的知识，是国家级一流本科专业建设点和国家特色专业。

飞行器动力工程 ：以航空航天动力，特别是航空发动机为对象，培养动力研究和设计人才，是国家级一流本科专业建设点、国家特色专业和江苏省品牌专业。

工程力学 ：旨在培养具有创新精神和实践能力的高级工程技术人才，在钱伟长班中表现突出。

机械工程 ：包括机械设计制造及其自动化、机械电子工程、车辆工程等，培养学生在机械工程领域的设计、制造和管理能力。

材料科学与工程 ：培养学生在材料科学与工程领域的研究和应用能力，涉及材料成型及控制工程、材料物理等材料科学领域的专业。

电子信息工程 ：作为国家级特色专业，培养学生在电子信息领域的理论和技术能力，毕业生主要从事电子产品的研发、设计、测试等方面的工作。

计算机科学与技术 ：培养学生在计算机科学与技术领域的编程、软件开发和网络技术能力，是南航的重点建设专业之一。

自动化 ：包括自动化和电气工程及其自动化，这两个专业社会认可度高，历年就业率较高，就业面广。

交通运输 ：培养方向包括民航机务、民航电子、空中交通管理和机场运行控制等，适应民航行业的需求。

航空服务艺术与管理 ：培养具有航空服务艺术和管理能力的人才，服务于航空公司和机场等民航相关单位。

这些专业在各自的领域内享有较高的声誉，并且为国内外航空航天事业培养了大量优秀人才。