上海之所以分开高考，主要原因可以归纳为以下几点：

高考改革试点的需要 ：上海作为全国第一批高考综合改革试点省市之一，需要自主命题来适应其特有的高考改革方案。

地方教育特色和实际情况 ：由于上海的高中教材、课程设置与其他省市存在差异，自主命题可以更好地反映本地的教育特色和实际情况。

减轻学生负担和提高教学质量 ：上海曾提出单独高考命题，旨在减轻学生负担，并通过会考减少高考科目，从而提高中学教学质量。

维护教育公平 ：尽管存在呼声要求全国使用统一试卷，但自主命题在一定程度上为特定省市提供了“保护色”，避免了外界对其教育质量的直接质疑，从而维护了高考制度的公平性。

教育管理的放权 ：高考分省命题是教育管理的放权之举，有利于体现地方特色，便于高校有针对性地选拔人才。

此外，上海实施每年有两次高考，且3+3的小科目可以自己选择科目组合，而并非文理综。上海高考满分660分，不是750，不区分一二三本，不区分文理。英语需要考听力，口语和翻译并计入总分，听力题在试卷上不写题目只写选项，题目都只在广播里读一遍，且是全英文试卷，题目内容和答题要求都用英语表示。

综上所述，上海分开高考的原因是多方面的，包括高考改革试点的需要、地方教育特色和实际情况、减轻学生负担和提高教学质量、维护教育公平以及教育管理的放权等。这些因素共同作用，使得上海能够自主命题，并实施了与其他省市不同的高考制度和模式。