2025年军队指挥系的主要专业包括以下几类：

步兵专业：适合希望成为步兵部队指挥官的学生，虽然较苦较累，但在分配上有很大优势，且转向其他专业相对容易。

军事管理学：培养具有领导和管理能力的军事人才，适合有志于成为军队高级指挥官的学生。

军事训练与管理：专注于军事训练的组织、实施和评估，适合希望从事军事教育和管理工作的学生。

指挥自动化专业：结合信息技术和军事指挥，培养能够指挥自动化系统的军官。

作战指挥专业：培养具备现代战争理论和作战指挥方法的军事人才，毕业生通常会被分配到军队的各级指挥机构，从事作战指挥、部队管理等工作。

侦察情报：培养具备侦察与情报处理能力的军事人才，毕业生通常会被分配到军队的侦察部队、情报部门等机构，从事侦察情报的搜集、分析、处理等工作。

这些专业对学生的身体素质、文化基础、政治素养和个人气质都有较高要求，适合有志于从事军事指挥和管理工作的学生。选择时应结合个人兴趣和职业规划，选择最适合自己的专业。