同济大学在其发展过程中，合并了多所高校，具体包括：

上海城市建设学院 ：1996年并入同济大学。

上海建筑材料工业学院 ：1996年并入同济大学。

上海铁道大学 ：2000年并入同济大学。

上海航空工业学校 ：2003年划归同济大学管理。

江南工学院 ：原江南工学院（原名南洋公学）在1952年全国院系调整后并入同济大学。

同济医学院 ：原同济医学院（原名上海德和医院医学堂）在1952年全国院系调整后并入同济大学。

大夏大学 ：原大夏大学（原名圣约翰大学）在1952年全国院系调整后并入同济大学。

这些合并使得同济大学在土木工程、建筑学等学科领域实力更为雄厚，成为国内顶尖的综合性研究型大学。