新疆专升本可以选择的院校包括以下几类：

公办院校 ：

新疆医科大学

新疆师范大学

新疆农业大学

塔里木大学

喀什大学

伊犁师范大学

新疆财经大学

新疆艺术学院

昌吉学院

新疆工程学院

新疆警察学院

新疆科技学院

新疆理工学院

新疆第二医学院

新疆政法学院

民办院校 ：

新疆天山职业技术大学

正在筹建中的本科院校 ：

新疆和田学院

新疆农业职业技术大学

新疆交通职业技术大学

新疆工业职业技术大学

新疆铁道与能源职业技术大学

建议：

优先考虑知名度和教学质量 ：如塔里木大学、喀什大学、新疆财经大学等。

考虑专业需求 ：根据自己的兴趣和职业规划选择相应的专业，比如医学、教育、农业等。

关注院校发展动态 ：由于高校升格或合并，招生院校可能会有变化，建议定期查看最新的招生信息。