南京拥有多所设有研究生院的大学，具体包括：

南京大学

涵盖文学、历史、理学、工学、农学等多个学科领域。

东南大学

提供土木工程、交通运输工程、生物医学工程等学科。

南京农业大学

专注于农业领域的研究。

南京航空航天大学

以航空航天为特色，涵盖航空宇航科学与技术、力学、控制科学与工程等学科。

南京理工大学

国防985 211高校，涵盖计算机科学与技术、电子科学与技术、材料科学与工程等。

南京师范大学

提供多样化的研究生教育项目。

南京医科大学

在医学领域提供研究生项目。

南京工业大学

覆盖多个学科领域。

南京邮电大学

在信息科学和技术领域提供研究生项目。

南京财经大学

在经济学、管理学等领域提供研究生项目。

南京审计大学

在审计、财政等领域提供研究生项目。

河海大学

在水利工程、环境科学等领域提供研究生项目。

南京信息工程大学

在信息科学和技术领域提供研究生项目。

中国药科大学

在中医药领域提供研究生项目。

这些大学在各自领域内都有较高的学术水平和研究实力，因此吸引了许多有志于深造的学生报考研究生。建议学生在选择学校和专业时，综合考虑自己的兴趣和职业规划，选择最适合自己的学校。