自动化专业通常设置在以下几种类型的学院中：

自动化学院 ：专注于自动化专业的教学和科研，例如北京航空航天大学自动化科学与电气工程学院、清华大学自动化系、浙江大学控制科学与工程学院等。

控制科学与工程学院 ：通常包含自动化专业，强调控制理论及其工程应用，如清华大学自动化系、浙江大学控制科学与工程学院等。

机械与电气工程学院 ：在一些院校中，机械设计及其自动化、机械电子工程、电气工程和自动化等专业可能会设置在同一个学院下。

电气信息工程学院 ：有些学校将自动化专业与电气类专业组合在一起，形成电气信息工程学院，如北京航空航天大学的自动化科学与电气工程学院。

信息工程与自动化学院 ：有些学校设有信息工程与自动化学院，自动化专业可能归属于此学院。

电子信息工程学院 ：有些学校将自动化专业与电子信息类专业组合在一起，形成电子信息工程学院。

信息科学技术学院 ：如清华大学自动化系，隶属于此学院，专注于自动化领域的人才培养和科技创新。

电气工程学院 ：有些学校将自动化专业归入电气工程学院，如北京航空航天大学的电力电子技术学科隶属于自动化科学与电气工程学院。

综上所述，自动化专业的学院设置因学校而异，但常见的设置有自动化学院、控制科学与工程学院、机械与电气工程学院、电气信息工程学院和信息工程与自动化学院等。具体归属哪个学院取决于不同大学的院系设置和自动化专业的专业方向。