南京的综合性大学包括但不限于以下几所：

南京大学 ：简称“南大”，是教育部直属的全国重点大学，历史悠久，声誉卓著。

东南大学 ：简称“东大”，是教育部直属并与江苏省共建的全国重点大学，以工科著称。

南京农业大学 ：以农业科学与生命科学为特色，多学科协调发展。

南京航空航天大学 ：简称南航，以理工类为主，具有航空航天民航特色。

南京理工大学 ：以工科为主，是工业和信息化部直属的全国重点大学。

河海大学 ：以水利为特色，理工为主，多学科协调发展。

南京师范大学 ：属于综合评价B类中的211院校，在师范类专业方面享有较高声誉。

南京工业大学 ：虽然具体信息较少，但也被视为综合性大学。

这些大学涵盖了文、理、工、医等多个学科领域，是南京地区高等教育的重要组成部分。建议根据个人兴趣和专业需求选择合适的大学进行报考。