化学专业考研自命题的学校包括以下几所：

哈尔滨工业大学

华南理工大学

郑州大学

中南大学

华东理工大学

四川大学

天津大学

北京化工大学

太原理工大学

北京大学

清华大学

复旦大学

南京大学

浙江大学

北京航天航空大学

兰州大学

上海交通大学

中国矿业大学

中国地质大学（武汉）

武汉理工大学

中国石油大学（北京）

华中农业大学

南京农业大学

东北师范大学

济南大学

青岛科技大学

成都理工大学

齐鲁工业大学

河南科技学院

常州大学

中南民族大学

三峡大学

海军工程大学

湖南农业大学

湖南师范大学

重庆师范大学

江西农业大学

福建师范大学

福建农林大学

中国人民大学

西南财经大学

这些学校中，有些是985和211高校，有些则是双非院校。建议考生在选择学校时，综合考虑自己的兴趣、专业实力和学校的整体情况。