亳州学院设有多个教学院系，具体包括：

中文与传媒系

电子与信息工程系

经济与管理系

教育系

中药学院

外语系

生物与食品工程系

美术系

音乐系

体育系

马克思主义学院

此外，根据最新的信息，亳州学院还设有以下专业：

小学教育（师范）

学前教育（师范）

制药工程

中药学

药学

药物制剂

药物分析

护理学

医学检验技术

文化产业管理

汉语言文学

网络与新媒体

生物工程

生物制药

酿酒工程

食品科学与工程

食品营养与健康

建议以学校最新公布的信息为准，如有变动，请参考官方最新公告。