乳品工程专业较好的学校有以下几所：

东北农业大学 ：乳品工程专业为“国家一流专业建设点”，软科专业排名连续两年位列A+，排名全国第一。该专业也是飞鹤乳品产业学院的领办专业，并举办了第四届“骆承庠杯”乳品工程创新竞赛。

华南农业大学 ：乳品工程研究方向涵盖食品包装、保藏、微生物、农产品加工、粮油、水产品加工等。学院拥有食品博士点和博士后流动站，博士研究生导师和硕士研究生导师人数较多，院士1人。

江南大学 ：江南大学在乳品工程领域也有很高的声誉，虽然未在上述排名中位列第一，但作为“211”和“985”高校，其实力和学术水平都非常高。

扬州大学 ：扬州大学在乳品工程专业方面也有很好的表现，位列全国乳品工程专业排名第三。

河南科技大学 ：河南科技大学在乳品工程专业方面排名第四，显示出其在乳品工程领域的较强实力。

黑龙江东方学院 ：虽然是一所民办高校，但在乳品工程专业方面表现突出，位列全国乳品工程专业排名第四。

内蒙古农业大学 ：内蒙古农业大学在乳品工程专业方面也有很好的表现，位列全国乳品工程专业排名前四。

综上所述，东北农业大学在乳品工程专业方面具有显著优势，是首选的学校。如果考虑其他因素如地理位置、学科特色或实验室设施等，华南农业大学、江南大学、扬州大学、河南科技大学、黑龙江东方学院和内蒙古农业大学也都是不错的选择。