复旦大学截至2014年年底，下辖31个直属院系，具体包括：

中国语言文学系

外国语言文学学院

新闻学院

历史学系

文物与博物馆学系

哲学学院

社会发展与公共政策学院

国际关系与公共事务学院

法学院

经济学院

数学科学学院

物理学系

核科学与技术系

化学系

此外，复旦大学还有其他一些院系，如：

复旦学院

旅游系

广告学系

广播电视系

传播学系

英语语言文学系

德语语言文学系

俄语语言文学系

翻译系

法语语言文学系

日语语言文学系

朝鲜语（韩语）

大学英语教学部

艺术设计系

高分子科学系

环境科学与工程系

生态与进化生物学系

遗传学和遗传工程系

微生物学与微生物工程系

生物化学系

生理学与生物物理学

电子工程系

通信科学与工程系

光科学与工程系

光源与照明工程系

微电子学系

计算机科学技术学院

材料科学系

力学与工程科学系

财务金融系

会计学系

统计学系

产业经济学系

企业管理学系

信息管理与信息系统系

管理科学系

市场营销系

上海医学院

公共卫生学院

药学院

护理学院

软件学院

微电子研究所

国际文化交流学院

复旦大学上海视觉艺术学院

建议关注复旦大学的官方网站或相关公告，以获取最新的院系设置信息。