爱辉区至少有一所综合性普通本科院校，即 黑河学院 。黑河学院位于黑龙江省黑河市爱辉区学院路1号，提供包括文学、理学、工学、经济学等多个专业的教育。此外，爱辉区还有以下教育机构：

黑龙江省黑河农垦职业技术学院 ：这是一所特色为农业、林业、水利工程的高职院校，也位于黑河市爱辉区。

黑河技师学院 ：专注于培养高技能人才，同样位于黑河市爱辉区。

黑河市卫生学校 ：这是一所培养医疗卫生技术人才的中等专业学校，也位于爱辉区。

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