皖南医学院设有多个系，包括但不限于以下这些：

临床医学院

麻醉学院

医学影像学院

法医学院

口腔医学院

护理学院

药学院

人文与管理学院

公共卫生学院

检验学院

医学信息学院

公共基础学院（创新创业学院）

基础医学院

马克思主义学院

研究生学院

继续教育学院

建议以学校最新公布的信息为准，因为专业设置可能会有变动。