生物工程是一门综合性的应用科学，它结合了生物学原理和技术以及现代工程技术，如化工、机械、电子计算机等，对生物体或其功能进行定向改造。生物工程的主要方面包括：

遗传工程（基因工程） ：通过改变或添加特定的基因序列来实现对生物体的改造和控制，应用于农业、医学、工业等领域。

细胞工程 ：研究和操作细胞的技术，用于培养、分离、纯化、增殖和改造细胞，以实现对生物体的控制和改造。

微生物工程（发酵工程） ：利用微生物的特定功能进行大规模培养，生产有用的代谢产物或发挥其生理功能。

酶工程（生化工程） ：利用酶的催化功能，借助生物反应装置和工艺手段生产人类所需的产品。

生物反应器工程 ：为生物工程菌或细胞株创造良好的生长与繁殖条件，进行大规模培养。

此外，生物工程还包括一些交叉学科领域，如合成生物学，它集合了传统生物学、工程学及数学的知识体系和研究方法，涉及的领域相当广泛，包括生物技术、进化生物学、基因工程、分子生物学、生物信息学、系统生物学、生物物理及计算机科学等。

生物工程的应用领域非常广泛，包括农业、工业、医学、药物学、能源、环保、冶金、化工原料等，对人类社会的政治、经济、军事和生活等方面产生深远影响。