在新高考制度下，提高学生的自主权可以从以下几个方面入手：

增加考试科目和考试次数 ：通过“3+3”科目改革，学生可以根据自己的兴趣和特长选择更多的考试科目和考试次数，从而更全面地展示自己的能力和潜力。

扩大学科和课程选择权 ：学校应提供更多的学科和课程选择，以满足不同学生的需求。这不仅有助于学生找到最适合自己的学习路径，还能激发他们的学习兴趣和动力。

尊重学生的选择 ：在高考招生过程中，应尊重学生的选择，避免过度关注高考总分和状元等功利性指标。这有助于引导教育从应试教育转向素质教育，培养学生的综合素质和创新能力。

提高学生自主学习能力 ：教育学生学会独立思考、自主学习和自我管理。通过培养他们的研究心态和自主学习能力，学生可以更好地应对未来的挑战和机遇。

改革录取制度 ：完善高考录取制度，确保录取过程更加公平、公正、公开。这可以增强学生对高考制度的信任，提高他们的自主选择的积极性。

加强学校与学生的沟通 ：学校应加强与学生的沟通，了解他们的需求和期望，及时调整教育策略和课程设置，以更好地满足学生的个性化需求。

通过以上措施，可以逐步提高学生在新高考制度下的自主权，促进他们的全面发展。