自动化工程系通常包括以下专业：

自动化 ：研究如何使机器设备自动地完成工作，涉及自动控制原理、传感器技术等。

电气工程及其自动化 ：涵盖电力系统、电机与电力电子、控制理论等多个方向，培养具备电气工程和自动化技术的高级工程技术人才。

机械设计制造及其自动化 ：研究机械系统的设计、制造及其自动化，涉及机械电子工程、机器人技术等领域。

工业工程 ：致力于培养学生在工业领域的专业技能和综合素质，涉及生产过程优化、工程管理等方面。

计算机科学与技术 ：研究计算机系统的设计、开发和应用，在自动化系统中起到重要作用。

机电一体化技术 ：融合机械、电子、计算机和自动控制等技术，培养具备机电一体化产品设计、制造、调试和维护能力的技术人才。

智能控制技术 ：研究智能控制系统的设计、分析、调试和维护，培养具备智能控制系统集成、调试和维护能力的技术人才。

智能机器人技术 ：专注于智能机器人的研发、设计、制造和应用，培养能够从事智能机器人系统集成、调试、维护和管理的技术人才。

工业机器人技术 ：培养能够从事工业机器人系统的设计、安装、调试、编程和维护的高级技术人才。

电气自动化技术 ：培养具备电气设备和自动化系统的设计、安装、调试、运行和维护能力的技术人才。

工业过程自动化技术 ：专注于工业过程的自动化控制，培养能够从事工业过程自动化系统的设计、调试和维护的技术人才。

轨道交通信号与控制 ：培养具备轨道交通信号系统设计与控制能力的技术人才。

邮政工程 ：涉及邮政系统的自动化与信息化。

核电技术与控制工程 ：培养具备核电设备与自动化控制能力的技术人才。

智能装备与系统 ：培养具备智能装备与系统设计与控制能力的技术人才。

工业智能 ：培养具备工业智能化技术与应用能力的技术人才。

智能工程与创意设计 ：培养具备智能工程与创意设计能力的技术人才。

这些专业涵盖了自动化领域的多个方面，从基础理论到实际应用，为学生提供了多样化的学习和发展方向。