湖北医药学院设有多个二级学院，涵盖基础医学、公共卫生与管理、人文社科、临床医学、护理、药学、生物医学工程等多个领域。具体院系设置如下：

基础医学院

公共卫生与管理学院

马克思主义学院

人文社会科学学院

第一临床学院

第二临床学院

第三临床学院

第四临床学院

第五临床学院

第六临床学院

第七临床学院

第八临床学院

第九临床学院

护理学院

药学院

生物医学工程学院

口腔医学院

继续教育学院

研究生院

国际教育学院

临床技能教学培训中心

生物医药研究院

建议关注湖北医药学院官方网站以获取最新的院系设置和专业信息。