上海交通大学（简称“上交大”）在多个专业领域具有极高的声誉和影响力，以下是一些被广泛认为上交大最好的专业：

船舶与海洋工程- 全国排名第1，评为A++，达到世界一流水平。该专业不仅在国内处于领先地位，还在深海探测、海洋新能源开发等新兴领域不断取得突破。

环境科学与工程- 全国排名第1，评为A++，在中国具有顶尖的地位。

生物工程- 全国排名第1，评为7星，属于世界知名高水平。

生物医学工程- 全国排名第1，同样评为7星，属于世界知名高水平。

信息工程- 全国排名第2，评为A++，属于世界知名高水平专业。

机械工程- 全国排名第2，评为7星，属于世界知名高水平。

材料科学与工程- 全国排名第2，评为7星，在中国顶尖的专业地位。

临床医学- 全国排名前列，依托上海交通大学医学院的丰富教育资源，教学资源丰富，学生能够在先进的医疗设备和资深专家的指导下，参与前沿医疗技术的研究与应用。

电气工程与自动化- 师资力量强大，授课水平高，在全国高校中排名靠前，培养的是能够从事电气工程相关系统运行的优秀人才。

此外，根据最新的学科评估结果，上海交大在多个学科领域也表现优异，例如船舶与海洋工程、临床医学、基础医学、口腔医学等总计12个学科进入前3%。

综上所述，上交大最好的专业主要集中在工程类和医学类专业，这些专业不仅在国内具有极高的声誉，还在国际上享有盛誉。建议学生在选择专业时，可以根据自己的兴趣和职业规划，优先考虑这些专业。