扬州大学最冷门的专业可能因时间、评价标准和数据来源的不同而有所变化。以下是一些被提及的冷门专业：

土木工程

建筑学

植物保护

化学类（包含专业：化学、应用化学）

兽医学

宗教学专业

历史学专业

博物馆学专业

古生物学专业

生物技术

化学工程

法学

这些专业在某些评价中被认为是冷门，可能是因为它们相对较新、招生规模较小、或者就业前景相对不太乐观。然而，这些专业也有其独特的优势，例如兽医学的师资综合实力强劲，就业率百分之百，而某些冷门专业如哲学、历史学等在考研方面表现优秀。

因此，选择专业时，建议学生综合考虑自己的兴趣、职业规划以及专业的实际就业情况和发展前景，而不应仅仅依据专业的冷热程度来决定。