雷军在大学时期的收入情况如下：

大三时通过编程赚取第一个100万。

大学时期通过奖学金和稿费、写软件赚到4000块。

大学二年级暑假到三年级开学前，通过编写一款加密软件赚到50元。

综合以上信息，雷军在大学时期的收入来源包括编程、奖学金、稿费和写软件。具体金额方面，他在大三时通过编程赚取了第一个100万，大学时期通过奖学金和稿费、写软件总共赚到4000块，此外还在大学二年级暑假通过编写加密软件赚了50元。