常州工学院的王牌专业排名如下：

飞行技术：

全国排名第9名。

航空服务艺术与管理：

全国排名第9名。

飞行器制造工程：

全国排名第19名。

机械设计制造及其自动化：

全国排名第155名。

电气工程及其自动化：

全国排名第138名。

电子信息工程：

全国排名第159名。

计算机科学与技术：

全国排名第278名。

物流管理：

全国排名第136名。

数字媒体艺术：

全国排名第36名。

产品设计：

全国排名第63名。

土木工程：

国家级特色专业。

建议优先选择飞行技术、航空服务艺术与管理、飞行器制造工程这三个专业，因为它们在全国的排名较高，更受认可。同时，机械设计制造及其自动化、电气工程及其自动化、电子信息工程、计算机科学与技术、物流管理、数字媒体艺术等专业也是学院的王牌专业，具有较高的教学水平和就业前景。