北碚区至少有三所大学，分别是：

西南大学：

西南大学是一所公办本科大学，也是211工程高校，位于北碚城区内，占地面积8270亩，是重庆面积最大的大学之一。西南大学设有多个校区，包括北碚和荣昌校区，提供广泛的本科专业和博士后科研流动站。

重庆师范大学：

重庆师范大学是重庆市最早成立的高等师范学校之一，其北碚校区位于重庆北碚城北新区。该校提供多个本科专业，是重庆市小学教师教育的重要基地。

重庆青年职业技术学院：

重庆青年职业技术学院是一所位于北碚区的公办职业技术学院，提供职业技能培训和相关教育服务。

综上所述，北碚区至少有三所大学，分别是西南大学、重庆师范大学和重庆青年职业技术学院。