大连海事大学设有 至少21个教学科研机构。具体学院包括航海学院、轮机工程学院、船舶电气工程学院、信息科学技术学院、交通运输工程学院、航运经济与管理学院、船舶与海洋工程学院、环境科学与工程学院、人工智能学院、法学院、外国语学院、公共管理与人文艺术学院、马克思主义学院、理学院、国际联合学院、体育工作部、创新创业学院、继续教育学院（交通运输高级研修学院）、航海训练与工程实践中心、人文社科研究院（航运发展研究院）、留学生教育中心等。