东北大学曾经分出以下几所院校：

1. 1958年分设沈阳建筑工程学院，为国内最早学建筑的高等院校之一，2000年与沈阳建筑大学合并。

2. 1960年分设沈阳农业工程学院，2003年更名沈阳农业大学。

3. 1961年分设沈阳化工学院，2000年改为东北大学化学化工学院。

4. 1961年分设沈阳机械工业学院，2000年更名为沈阳工业大学。

此外，东北大学在1996年入选首批211高校，2001年成为985高校。

综上所述，东北大学至少曾经分出4所学校，并且与其他多所高校有学科和系的合并。