大连海事大学最好的三个专业可以综合多个来源的信息得出，以下是根据不同排名和评价整理出的三个最佳专业：

航海技术

全国排名：

全国排名第2

专业特色：涵盖航海安全、航行管理、船舶操作等多个方面，培养航海领域高素质的专门人才

轮机工程

全国排名：

全国排名第3

专业特色：主要涉及船舶发动机、动力系统、节能技术等方面，培养轮机领域的专门人才

交通运输工程

全国排名：

全国排名第9

专业特色：注重培养学生的交通运输规划、设计、管理等方面的能力，毕业生在交通运输领域具有较高的竞争力

这三个专业不仅在大连海事大学内部具有较高的教学质量和学术研究水平，而且在全国范围内也得到了广泛认可。建议对航海技术、轮机工程和交通运输工程感兴趣的学生优先考虑这些专业。