南京有多所大学设有分校，具体数量如下：

南京大学：

南京大学有2个校区，分别为鼓楼校区和仙林校区。

南京师范大学：

仙林大学城中的南京师范大学。

南京财经大学：

仙林大学城中的南京财经大学。

南京邮电大学：

仙林大学城中的南京邮电大学。

南京中医药大学：

仙林大学城中的南京中医药大学。

南京信息职业技术学院：

仙林大学城中的南京信息职业技术学院。

南京理工大学紫金学院：

仙林大学城中的南京理工大学紫金学院。

应天学院：

仙林大学城中的应天学院。

南京森林警察学院：

仙林大学城中的南京森林警察学院。

南京体育学院：

仙林大学城中的南京体育学院。

南京工业职业技术学院：

仙林大学城中的南京工业职业技术学院。

南京外国语学校仙林分校：

仙林大学城中的南京外国语学校仙林分校。

南京国际学校：

仙林大学城中的南京国际学校。

综上所述，南京至少有13所大学设有分校。