截至2024年，扬州大学进入ESI全球排名前1%的学科数已达到 13个，分别是：

1. 化学

2. 植物与动物科学

3. 工程学

4. 农业科学

5. 临床医学

6. 材料科学

7. 计算机科学

8. 生物学与生物化学

9. 药理学与毒理学

10. 环境生态学

11. 微生物学

12. 分子生物学与遗传学

13. 免疫学。