杭州至少有一所大学合并过，即 浙江大学。1998年，浙江大学合并了杭州大学、浙江农业大学和浙江医科大学，成为一所综合性大学。此外，杭州科技职业技术学院在2009年由杭州成人科技大学和杭州广播电视大学合并升格而来，并在同年，杭州职业技术学院附属严州中等专业学校并入杭州科技职业技术学院。最近的一次合并是浙江海洋大学东海科学技术学院与浙江医药高等专科学校在2023年10月16日合并，更名为浙江药科职业大学。