清华大学校内至少有以下商店：

天猫超市：

清华校园内有三家分店。

艺术商店：

位于清华大学艺术博物馆内，专门售卖文创产品。

文具店：

例如“紫日金利”，位于图书馆后面的学生休闲长廊、C楼后地下超市、照澜院、清芬园南面的紫荆超市等地。

菜鲜果美超市：

位于照澜院购物中心1层，提供新鲜水果等商品。

旧书店：

未具体提及位置，但应有一至两家旧书店在校园内。

清华印象文创店：

这是清华大学文化处直属的实体店铺，位于校内文化产业园区，同时也有线上店铺。

其他店铺：

包括金凤呈祥（东门）、味多美、五道口地区、西点工坊（大学北门）、二手书店、万人食堂东侧铁楼二楼的独峰书院、听涛食堂二楼的教材书店等周边店铺。

综上所述，清华大学校内至少开了六家商店，如果考虑周边店铺，数量可能会更多。这些店铺为清华师生提供了丰富多样的商品和服务，满足了日常生活的需求。