日军在攻占北平期间，对高等学校进行了严重的破坏和摧残。以下是一些被日军占领或影响的大学：

北京大学：

1937年7月29日北平沦陷后，日军于8月25日侵入并接管北大，校园惨遭蹂躏，红楼成了日寇的宪兵指挥部。

清华大学：

1937年7月29日北平沦陷后，日军于10月13日大规模进驻清华园，清华园被完全侵占。

北平师范大学：

抗战爆发前夕，北平共有专科以上院校23所，其中包括北平师范大学。

北平大学：

抗战爆发前夕，北平共有专科以上院校23所，其中包括北平大学。

北平铁道管理学院：

抗战爆发前夕，北平共有专科以上院校23所，其中包括北平铁道管理学院。

中法大学：

抗战爆发前夕，北平共有专科以上院校23所，其中包括中法大学。

燕京大学：

抗战爆发前夕，北平共有专科以上院校23所，其中包括燕京大学。

辅仁大学：

抗战爆发前夕，北平共有专科以上院校23所，其中包括辅仁大学。

中国学院：

抗战爆发前夕，北平共有专科以上院校23所，其中包括中国学院。

朝阳学院：

抗战爆发前夕，北平共有专科以上院校23所，其中包括朝阳学院。

华北文法学院：

抗战爆发前夕，北平共有专科以上院校23所，其中包括华北文法学院。

北平协和医学院：

抗战爆发前夕，北平共有专科以上院校23所，其中包括北平协和医学院。

北平铁路学院：

抗战爆发前夕，北平共有专科以上院校23所，其中包括北平铁路学院。

北平民国学院：

抗战爆发前夕，北平共有专科以上院校23所，其中包括北平民国学院。

平民学院：

抗战爆发前夕，北平共有专科以上院校23所，其中包括平民学院。

综上所述，日军在攻占北平期间，至少占领了上述15所大学。这些大学在战争期间受到了严重的破坏和摧残，许多学者和教授被迫南迁，教育资源严重流失。