重庆96个志愿的录取顺序遵循以下原则：

分数优先：

录取时按照高考成绩总分的高低进行排序，分数高的考生先投档录取。

遵循志愿：

在分数相同的情况下，按照考生填报的志愿顺序依次进行录取。即先录取第一志愿，如果第一志愿无法录取，则录取第二志愿，以此类推。

一轮投档：

每个考生在每一批次中只能被投档一次，若第一志愿未能录取，其后的志愿将不再被检索。

具体录取步骤如下：

1. 对每个考生，先按照其高考成绩总分从高到低进行排序。

2. 按照排序结果，依次检索考生填报的志愿，先录取第一志愿，若第一志愿未能录取，则录取第二志愿，以此类推，直到所有志愿检索完毕。

3. 在每个志愿的录取过程中，若该志愿的学校或专业已满额，则不再考虑后续志愿，直接跳到下一个志愿。

建议考生在填报志愿时，合理配置冲稳保志愿，按照自己的成绩和兴趣合理排序，以提高录取机会。