高考选择日语作为外语科目的考生在报考专业时，确实可能会面临一些限制。以下是一些主要的限制情况：

军事、国防和公共安全等特殊专业：

这些专业对统考外语语种有限制，日语考生不能报考此类特殊专业。根据教育部的规定，除军事、国防和公共安全等部分特殊院校（专业）外，高校不得对报考非外国语言文学类专业的考生作统考外语语种限制。

其他语言类专业（除日语外）：

部分学校的外语专业对日语有限制，日语考生不能报除日语以外的其他语言类专业。例如，山东师范大学规定英语（公费师范生）、外国语言文学类（英语）只招收英语语种考生，其余各专业（类）不限制外语语种。

中外合作办学类专业：

极少数情况下，这些专业只招收英语考生，虽然大部分学校不做要求，但招生简章中会提醒小语种考生谨慎报考。

与英语关联性较强的专业：

一些专业如英语语言文学、商务英语、国际经济与贸易等，由于研究和学习重点集中在英语语言、文学和商务英语沟通方面，对考生的英语水平有较高要求。

传媒、国际关系、外交类专业：

这些专业通常涉及国际交流、文化传播等领域，需要考生具备良好的英语沟通能力，因此日语考生可能会受到限制。

部分医学、法学专业：

这些专业涉及大量的专业术语和国际交流，通常需要考生具备较高的英语水平，因此日语考生可能会受到限制。

语种教学限制：

部分高校虽然开设了日语专业，但在课程设置和教学上可能会有一定的限制，例如要求日语专业的学生必修英语或其他外语课程。

学习资源限制：

由于中国的日语教育市场相对较小，且部分高校对日语专业的投入不足，日语专业的学生在学习资源上可能会受到一定的限制。

综上所述，高考日语受限的专业主要包括军事、国防和公共安全等特殊专业，其他语言类专业（除日语外），中外合作办学类专业，与英语关联性较强的专业，部分医学、法学专业，语种教学限制以及学习资源限制。建议考生在报考时仔细查阅所填报高校的《招生章程》，了解相关限制和要求。