二级建造师在取得一个专业的资格证书后，可以选择报考其他专业作为增项。在注册时， 只能注册两个专业，一个为主项专业，另一个为增项专业。因此，如果你已经考取了三个专业，建议选择其中一个作为主项专业，另外两个作为增项专业进行报考和注册。

具体操作步骤如下：

选择主项专业：

根据你的工作实际需要或市场需求，选择一个专业作为主项专业进行报考和注册。

报考增项专业：

在取得主项专业的资格证书后，再报考另外两个增项专业。每个增项专业都需要通过相应的考试。

注册专业：

在注册时，将主项专业和两个增项专业一起注册。注意，每个专业每隔两年需要进行一次继续教育，并且必须交费。

需要注意的是，虽然二级建造师可以报考多个专业，但实际注册时只能注册两个专业。因此，在报考和注册时，建议选择最符合自己工作实际需要或市场需求的专业，以确保能够顺利注册并从事相关工作。