南京理工大学的军工专业就业方向主要包括以下几个方面：

国有兵器装备厂：

包括弹药厂、通信厂、飞机厂等，主要从事设计工程师、制造工程师、技术工程师等岗位。

私营兵器公司：

在兵器装备领域有较大的市场空间和需求，提供较高的薪酬，常见岗位包括项目工程师、初级工程师、技术员等。

相关科研院所：

如兵器研究院等，需要相关专业的研发型人才，考虑岗位包括研究员、高级工程师、助理研究员等。

高等学校：

毕业生可以进入高校从事教学和研究工作。

部队：

虽然南理工不是军校，不隶属部队，但毕业生可以报名参军，并且非常受部队欢迎。

民用爆破行业：

随着国家对民用爆破行业的逐步开放，兵器类专业毕业生也可以选择从事民用爆破行业的相关工作。

总体来说，南京理工大学军工专业的就业前景比较广阔，但具体就业情况还需根据市场需求和个人的能力情况而定。建议毕业生在就业时多关注行业动态，提升自身专业技能，以增加就业竞争力。