在大学跑步比赛中，男生1000米跑的合格标准根据不同的年级有所不同：

大一和大二：

及格成绩为4分32秒。

大三和大四：

及格成绩为4分30秒。

因此，可以得出以下结论：

大一和大二：男生1000米跑的合格标准是4分32秒。

大三和大四：男生1000米跑的合格标准是4分30秒。

这些标准适用于国内大多数大学，但具体标准可能因学校或地区的不同而有所调整。建议参考所在学校或地区的具体体育测试标准。