济宁学院目前有以下几个校区：

北湖校区：

位于济宁市北湖风景区内，是济宁学院的主校区。

曲阜校区：

位于济宁市曲阜市内，是济宁学院的分校区之一。

运河校区：

位于济宁市运河风景区内，是济宁学院的分校区之一。

济宁校区：

位于济宁市市区内，是济宁学院的分校区之一。

济宁高新区大学园应用型人才培养基地：

位于山东省济宁市高新区海川路16号。

初等教育学院（曲阜师范校区）：

位于曲阜市。

因此，济宁学院至少有一个主校区和五个分校区，共计六个校区。