菲律宾日本大学的学费情况如下：

大学学部入学第一年的费用

国立大学（不分学科）：753,800日元。

公立大学（不分学科）：858,286日元。

私立大学（根据学科平均）：

文学、教育：约115万日元。

经济、法律：约108万日元。

理工：约137万日元。

医学：约468万日元。

药学：约215万日元。

日本大学大学院学费

研究生（修士预科）期间：

报名费：9800日元（约588元）。

入学金：84600日元（约5076元）。

学费：29700日元/月（约1782元）。

修士期间：

名费：30000日元（约1800元）。

入学金：282000日元（约16920元，只第一年交）。

学费：535800日元/年（约32148元）。

日本语言学校学费

一般日本国公立大学一年学费约为3.8万人民币，包括535800日元+入学金282000日元=817800日元（约3.8万人民币/年），其中学费半年一缴，入学金只有第一学期收。

建议根据具体申请的学科和大学类型（国立、公立、私立）来详细确认学费金额，因为不同学科的学费差异较大。