烟台南山学院拥有多个王牌专业，以下是一些被广泛认为较好的专业：

自动化专业：

多次被列为王牌专业，并且在多个排行榜中表现突出。

材料成型及控制工程：

被评为省级一流本科专业，也是国家级教学改革试点专业之一。

电气工程及其自动化：

同样是省级一流本科专业，并且在某些排行榜中位于前列。

纺织工程：

在某些年份被评为省级一流本科专业，并且在录取分数线方面表现较好。

旅游管理专业：

被认为是学院的优势专业之一。

电子信息工程：

根据某些评价，该专业是学院最好的专业之一。

计算机科学与技术专业：

在某些排行榜中表现良好，并且注重学生计算机基础理论和实践技能的培养。

机械设计制造及其自动化专业：

在某些评价中，该专业被认为是学院最强的专业之一。

此外，根据2023年内蒙古理科的录取情况，烟台南山学院录取分数线最高的四个专业是人工智能、自动化、机械设计制造及其自动化和化学工程与工艺。

综合以上信息，烟台南山学院最好的专业包括自动化、材料成型及控制工程、电气工程及其自动化、纺织工程、旅游管理、电子信息工程、计算机科学与技术以及机械设计制造及其自动化。这些专业在多个方面都有显著表现，并且得到了广泛的认可和好评。