云南农业大学的冷门专业包括：

烟草学：

该专业在云南农业大学有开设，且属于农学门类。根据软科官网的数据，开设烟草学专业的院校数量较少，属于冷门专业。

农艺教育：

该专业在云南农业大学有开设，且属于农学门类。根据软科官网的数据，开设农艺教育专业的院校数量较少，属于冷门专业。

园艺教育：

该专业在云南农业大学有开设，且属于农学门类。根据软科官网的数据，开设园艺教育专业的院校数量较少，属于冷门专业。

康复学（听力）：

该专业在浙江中医药大学有开设，且属于医学门类。虽然云南农业大学没有明确列出该专业，但根据提供的信息，可以推测该专业属于冷门专业。

茶艺：

虽然云南农业大学有开设茶艺专业，但根据提供的信息，该专业的冷门程度较低，且就业前景相对可观。

咖啡科学与工程：

云南农业大学在2024年成功申报并开设了“咖啡科学与工程”专业，成为全国乃至全球首个开办咖啡本科人才培养的专业点。该专业属于国家特色专业，满足经济社会发展特殊需求，但根据提供的信息，可以推测该专业在初期属于冷门专业。

综上所述，云南农业大学的冷门专业主要集中在农学门类，包括烟草学、农艺教育、园艺教育等。此外，康复学（听力）和咖啡科学与工程专业虽然较为特殊，但也属于冷门专业范畴。