截至2024年3月29日，中国高校在科学引文索引（SCI）期刊上发表的论文数量显著增长，总计超过 87万篇。这一数字显示了近年来中国高校在科研产出上的显著提升。

需要注意的是，SCI论文的发表数量和质量因学校、学院、研究方向和导师要求等因素而异。例如，一些顶尖大学如清华大学、北京大学等，在科研产出上稳居前列，而一些学院或专业可能更注重论文的质量而非数量。此外，博士生的SCI论文发表要求也会因学校不同而有差异，有的学校可能要求1-3篇SCI论文才能毕业。

综上所述，中国高校每年发表的SCI论文数量约为87万篇。这一数字反映了中国高校在科研领域的整体实力和进步，但不同学校和学院之间存在差异。