以下是一些被认为是集美大学的冷门专业：

交通运输专业：

这是一个二本批专业，培养具备运筹学、管理学、交通运输组织学等方面知识的高级技术人才。

机械电子工程专业：

同样是二本批专业，专业培养机电结合，掌握机械工业自动化、电力电子和计算机应用等技术的高级工程技术人才。

食品科学与工程专业：

这个专业培养具有化学、生物学、食品工程和食品技术知识的高级工程技术人才，能在食品领域内从事食品生产技术管理、品质控制、产品开发、科学研究、工程设计等方面工作。

机械工程专业：

这个专业培养从事机械设备设计、生产制造、检测及控制、使用及维修的高级工程技术人才。

网络工程专业：

研究计算机网络的体系结构、数据通信控制、资源共享、网络信息安全的方法规律，涉及网络信息管理、管理知识和经济知识等。

水生动物医学专业：

这是一个一本批专业，培养具备水产动、植物增养殖科学的基本理论、基本知识和基本技能的高级科学技术人才。

水产养殖学专业：

同样是一本批专业，专业培养具备水产动、植物增养殖科学的基本理论、基本知识和基本技能，能在水产养殖生产、教育、科研和管理等部门从事科学研究、教学、水产养殖开发、管理等工作的高级科学技术人才。

海洋渔业科学与技术专业：

培养能在海洋渔业生产、教育、科研等部门从事科学研究、远洋渔业开发等工作的专业人才。

环境工程专业：

培养在环境保护、污染治理和生态修复等方面工作的专业人才。

生物科学专业：

研究生物学的基本理论和实验技能。

音乐学专业：

研究音乐的理论、表演和教育等方面。

舞蹈学专业：

研究舞蹈的表演、创作和教育等方面。

美术学专业：

研究美术的创作、鉴赏和教育等方面。

这些专业可能因为就业前景相对较窄或者专业特点不被广泛认知而被认为是冷门专业。建议学生在选择专业时，可以综合考虑自己的兴趣和职业规划，同时也可以咨询学长学姐或专业人士的意见，以做出更为明智的选择。