新高考二批的平行志愿数量是45个。在高考改革后，普通本科批次和高职（专科）批次的平行志愿数量均有所增加，以更好地满足考生的填报需求。具体到第二批本科，考生可以填报45个院校专业组平行志愿，每个院校专业组后面还可以设置6个专业志愿。这样的设置旨在提供更多的选择机会，减少因志愿数量不足而导致的遗憾。

建议考生在填报志愿时，充分了解自己的兴趣和职业规划，结合各高校的招生专业及选考科目要求，合理分配志愿数量，以提高录取的可能性。同时，考虑到改革后不再设置院校服从志愿，考生需要更加谨慎地选择院校和专业，确保志愿的有效性。