南通大学拥有多个优秀的专业，以下是一些被广泛认可的专业：

临床医学：

在江苏省内具有较高的声誉，毕业生在医疗系统内有较好的就业前景。

神经科学与行为学：

进入ESI学科全球排名前1%。

工程学：

进入ESI学科全球排名前1%。

药理学与毒理学：

进入ESI学科全球排名前1%。

生物学与生物化学：

进入ESI学科全球排名前1%。

化学：

进入ESI学科全球排名前1%。

材料科学：

进入ESI学科全球排名前1%。

分子生物与遗传学：

进入ESI学科全球排名前1%。

计算机科学：

进入ESI学科全球排名前1%。

经济与金融：

A级学科，专业排名全国第5。

秘书学：

A级学科，专业排名全国第12。

学前教育：

国家级一流本科专业。

生物科学：

国家级一流本科专业。

应用心理学：

国家级一流本科专业。

交通设备与控制工程：

国家级一流本科专业。

行政管理：

国家级一流本科专业。

视觉传达设计：

国家级一流本科专业。

历史学：

省级一流本科专业。

物理学：

省级一流本科专业。

电子科学与技术：

省级一流本科专业。

医学影像学：

省级一流本科专业。

口腔医学：

省级一流本科专业。

药学：

省级一流本科专业。

会计学：

省级一流本科专业。

翻译：

省级一流本科专业。

地理信息科学：

省级一流本科专业。

应用统计学：

省级一流本科专业。

测控技术与仪器：

省级一流本科专业。

软件工程：

省级一流本科专业。

音乐学：

省级一流本科专业。

31. 工程管理：省级一流本科专业。

32. 电子信息工程：国家级特色专业。

33. 电气工程及其自动化：国家级特色专业。

34. 英语：国家级特色专业。

35. 汉语言文学：国家级特色专业。

36. 预防医学：国家级特色专业。

37. 小学教育：省级品牌专业。

38. 机械工程专业：省级品牌专业。

39. 自动化专业：省级品牌专业。

40. 护理学专业：省级品牌专业。

这些专业在江苏省乃至全国都有较高的声誉，并且很多都是国家级特色专业或省级品牌专业。建议学生在选择专业时，可以综合考虑自己的兴趣和职业规划，选择这些具有较高声誉和就业前景的专业。